Com o objetivo de possibilitar o constante aperfeiçoamento técnico e científico de profissionais e pesquisadores da região, o IFSertãoPE oferece os seguintes cursos de pós-graduação:
- Lato Sensu (especialização)
- Stricto Sensu (mestrado)
O IFSertãoPE também oferece apoio para servidores que desejam realizar pós-graduação Stricto Sensu em outras instituições de ensino, seja em nível de mestrado (acadêmico ou profissional), doutorado ou pós-doutorado. Anualmente, são lançados editais específicos para a concessão de bolsas aos servidores da instituição que estejam vinculados a programas de pós-graduação Stricto Sensu, além de outras iniciativas voltadas para esta finalidade.